En esta área, ubicada en varias dependencias repartidas entre la última planta del edificio de la Alhóndiga y el Ayuntamiento Viejo, es donde se desarrollan aquellas tareas inherentes a la conservación, tratamiento, restauración, documentación, inventariado, difusión, etc. de los fondos del MAB; además de los espacios dedicados a administración y dirección. Está abierta así mismo a los investigadores externos, para lo que cuenta además con un servicio de biblioteca y archivo que alberga temporalmente el Archivo Histórico Municipal.